Uno de los problemas más comunes, es que se este olvidando de actualizar el archivo de instalación, requirements.txt Si no están las dependencias actulizadas correctamente con el siguiente comando: pip3 freeze > requirements.txt

Lo que te va a decir, es el mensaje que has mostrado, deberías revisar si esta actualizado con el siguiente comando: cat requirements.txt

Si lo dejas actualizado, todo debería funcionar perfectamente